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国家标准计划《生物DNA条形码分析及数据库规范》由 TC387(全国生化检测标准化技术委员会)归口 ,主管部门为国家标准委

主要起草单位 中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所中国医学科学院药用植物研究所中国检验检疫科学研究院中国水产科学研究院黄海水产研究所等

目录

基础信息

制修订
制定
项目周期
18个月
公示开始日期
2023-01-19
公示截止日期
2023-02-02
标准类别
基础
国际标准分类号
07.080
07 数学、自然科学
07.080 生物学、植物学、动物学
归口单位
全国生化检测标准化技术委员会
执行单位
全国生化检测标准化技术委员会
主管部门
国家标准委

起草单位

目的意义

DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的D N A 序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。

由于不同物种的DNA 序列是由腺嘌呤(A )、鸟嘌呤(G )、胞嘧啶(C )、胸腺嘧啶(T ) 四种碱基以不同顺序排列组成,因此对某一特定D N A 片段序列进行分析即能够区分不同物种。

当前。

DNA条形码技术已应用于科学研究、物种资源调查分类、食品安全、中药质控、海关检查、检验检疫等。

美国食品与药物管理局正式批准使用DNA条形码用于鱼产品的物种鉴定。

中国药典、英国药典、美国药典已将DNA条形码技术纳入法定鉴定方法。

DNA条形码数据库是DNA条形码鉴定得以执行的基础。

标准的DNA条形码鉴定流程包括供试品处理、DNA提取、DNA条形码序列PCR扩增、电泳检测和序列测定、序列拼接及结果判定等内容。

DNA条形码数据库是进行结果判定的基础,数据库是否完善,是否涵盖了待鉴定物种及其密切相关物种是DNA条形码库的基本要求,数据库中数据是否准确则关系到数据库可靠性及使用价值的核心。

有研究表明GenBank数据库中数据库的可靠性只有70%,因此多个国家权威研究机构纷纷构建了专用的数据库。

DNA条形码数据库构建技术研究已成为国际热点和难点,从2007年国际生命条形码联盟(CBOL)构建全球第一个DNA条形码数据库依赖,国际上已构建了近20个相关数据库,比较有代表性的有国际生物条形码数据库(BOLD)、国际鱼类数据库(Fish-BOL)、中药材DNA条形码数据库(TCM-BOL)和中国高等植物DNA条形码数据库。

中国高等植物DNA条形码数据库已经有超过12万条标准DNA条形码数据,涵盖了上万种中国常见高等植物和99版红皮书国家重点保护植物。

生物DNA条形码数据库构建仍缺乏统一标准,各个数据库的质量参差不齐,有超过一半的数据库无法进行正常访问。

生物DNA条形码数据库应包括应在标准规范下进行,包括物种范围的确定、DNA条形码序列的确定、DNA条形码鉴定接口开发、管理与维护等。

范围和主要技术内容

本文件规定了生物DNA条形码分析及数据库构建、使用和管理技术规范。 本文件适用于生物DNA条形码、微条形码的采集、处理、存储、使用和管理。 主要技术内容包括: 1 DNA条形码序列获取 1.1 DNA测序 1.2 测序质量评估和低质量序列去除。 1.3 一致性序列生成 1.4 一致性序列质量评价 1.5 一致性序列的使用 2 数据库构建流程 2.1 数据库建设目标和物种来源范围的确定 2.2 数据库组成设计 2.3 用于获取DNA条形码序列的材料选择 2.4 DNA条形码序列的获取与建立 2.5 DNA条形码序列的审核与入库 3 数据库质量控制 3.1 完整性 3.2 逻辑一致性 3.3 准确性 3.4 追溯性 3.5 现实性 4 DNA条形码数据库使用 4.1 数据库检索 根据数据存储的字段进行检索,应支持模糊匹配、多字段联合检索和检索结果间的多维度关联。 4.2 物种鉴定 将供试品DNA序列与DNA条形码数据库中的核酸序列进行计算比对,进而结合判定标准进行种属鉴别或鉴定。判定标准的制定应考虑不同物种的变异范围。核酸序列比对方法根据样品特点从以下三种方法中选择使用。 5 生物DNA条形码数据库的管理与维护 5.1 数据存储管理 5.2 数据使用管理 5.3 用户使用监测与性能定期监测 5.4 更新管理 5.5 生物条形码数据库的维护