国家标准计划《单细胞测序样本采集与处理规范》由 TC559(全国生物样本标准化技术委员会)归口 ,主管部门为国家标准委。
主要起草单位 深圳华大生命科学研究院 。
| 07 数学、自然科学 |
| 07.080 生物学、植物学、动物学 |
本项目是为单细胞测序在样本采集、单细胞悬液及单细胞分选处理时,对方法选择及核心考量指标提供技术指导。
本项目作为一项基础标准,规定了单细胞测序在进行样本采集与预处理(包括单细胞悬液制备及细胞分选)时相关处理方法、技术指标、保存运输的要求。
限定了单细胞测序的样本的准入要求,从而提高测序的成功率及准确性,对于整个单细胞测序市场的规范起到了重要作用。
单细胞技术是第一次能够研究组织内每一个不同细胞的基因组、转录组、甚至多组学的系统研究。
通过与荧光标记、显微切割等其他技术结合,单细胞技术还可以测定组织中所有细胞的空间属性和相互作用。
这些技术正在或将在肿瘤、生殖、免疫等等许多生物医学领域中得到广泛的应用,2013-2020 年,单细胞测序技术多次被Science、Nature 等学术期刊评价为年度重点技术,正引领新一轮生物医学领域的技术革命。
对于单细胞测序,制备单细胞悬液是实验和数据分析的基础。
制备流程主要分外周血样本、组织样本、贴壁细胞三种样本单细胞悬液制备基本流程。
对于大多数类型的细胞,单细胞悬液的制备并不困难,但悬液的质量主要取决于实验人员的操作水平。
在悬液制备过程中,细胞活性、组织类型、杂质量等都将影响悬液的最终质量。
同时单细胞分选有多种方法,实际使用时需根据样本的实际情况和研究目的来选择合适的方法。
但是目前单细胞测序领域尚无相关的标准,对于单细胞测序样本的处理缺乏系统的设计和规范,无法保证处理方法的重复性和稳定性,进而无法保证经处理的样本符合最终的使用要求。
单细胞测序样本以及人力、经费的浪费现象严重。
为了促进单细胞测序推动我国基础研究的发展,特别是提升我国在生命科学研究的整体创新能力和国际竞争力,建立统一的单细胞测序样本预处理方法指南标准,在促进我国单细胞测序规范有序的发展具有重大国际战略意义。
范围: 本标准规定了单细胞测序样本采集与处理规范的基本技术要求。 本标准适用于单细胞测序过程中对待检样本的采集与处理规范。适用于外周血样本、冷冻动物组织样本、贴壁细胞样本。 主要技术内容: 主要技术内容包括:单细胞测序的样本采集、不同样本类型预处理方法选择、处理过程、相关技术指标及保存运输要求等。