国家标准计划《环境微生物宏基因组检测 高通量测序法》由 TC387（全国生化检测标准化技术委员会）归口 ，主管部门为国家标准化管理委员会。

主要起草单位 深圳华大生命科学研究院 、深圳华大基因科技有限公司 、深圳基因产学研资联盟 、中国测试技术研究院 、深圳华大临床检验中心有限公司 。

在各类环境中，包括外部自然环境及人体内环境，存在着数量巨大，种类繁多的微生物。

这些微生物功能各异，不但影响着环境的动态平衡，还与人体的健康状况密切相关。

随着高通量测序技术的快速发展，对环境微生物的研究已经摆脱了对于微生物培养技术的依赖，进入了大数据，高通量的领域。

随着人们对环境微生物认识的不断加深，在环境监测、治理，工、农业生产及健康评估、疾病诊断等领域，微生物的重要性正在不断凸显。

而环境微生物的检测，即对环境中微生物的种类与丰度进行定性、定量，则是所有科学研究与实践应用的基础，直接关系着科研结果的可信度与生产应用的可靠性。

尽管基于高通量测序的环境微生物检测如此重要，但目前国内却始终没有相对应的标准出台。

复杂的环境微生物群落，不规范的检测方法，极易造成数据的混乱及结论、结果的矛盾，严重影响了这一先进技术在各领域的推广和应用。

因此本标准规定了基于高通量测序技术检测鉴定微生物的方法，包括样本采集、样本制备、高通量测序的标准流程和测序数据的分析、处理方法，适用于使用高通量测序技术对环境样本中的微生物进行的检测和鉴定分析。

这一标准的建立和普及能够使得基于高通量测序的环境微生物检测技术流程做到规范化，统一化，进而在样本的可靠度和产出数据的通用性方面有显著的提升。

同时，这一标准的推广和实施，能够使得高通量测序技术的应用领域得到极大拓展，让健康、环境、农业等涉及微生物检测的各个行业有更统一和顺畅的评估、交流语境，并有力的推动这些行业的发展，为全民健康及工农业技术进步提供有力的保障和支持，促进科研及相关领域经济的发展。

因此本标准规定了基于高通量测序技术检测鉴定微生物的方法，包括样本采集、样本制备、高通量测序的标准流程和测序数据的分析、处理方法，适用于使用高通量测序技术对环境样本中的微生物进行的检测和鉴定分析。

这一标准的建立和普及能够使得基于高通量测序的环境微生物检测技术流程做到规范化，统一化，进而在样本的可靠度和产出数据的通用性方面有显著的提升。

同时，这一标准的推广和实施，能够使得高通量测序技术的应用领域得到极大拓展，让健康、环境、农业等涉及微生物检测的各个行业有更统一和顺畅的评估、交流语境，并有力的推动这些行业的发展，为全民健康及工农业技术进步提供有力的保障和支持，促进科研及相关领域经济的发展。

范围：本标准适用于使用高通量测序技术、运用宏基因组学方法对环境样本中的微生物进行的检测和鉴定分析。 主要技术内容：本标准规定了基于高通量测序技术宏基因组检测鉴定微生物的方法，包括样本的采集，微生物核酸样本的制备，高通量测序的标准流程和测序数据的分析、处理方法。

1、 国自然青年科学基金项目，项目编号：31601073，名称：基于宏基因组测序数据的原核微生物泛基因组构建及其可视化方法研究； 2、 国家自然科学基金面上项目，项目编号：81670606，名称：利用多组学手段研究肠道微生态与食物过敏之间的关联。