国家标准计划《咖啡浆果炭疽病菌检疫鉴定方法》由 TC271（全国植物检疫标准化技术委员会）归口 ，主管部门为国家标准化管理委员会。

主要起草单位 中华人民共和国宁波出入境检验检疫局 、中国科学院微生物研究所 。

咖啡浆果炭疽病菌 Colletotrichum kahawae Bridge and Waller 是一种重要的病原菌，它是造成整个非洲广泛种植的阿拉伯咖啡浆果病害的罪魁祸首，也是刺盘孢属真菌中唯一一个被我国和亚洲的其他国家以及拉丁美洲的一些国家列入检疫名录的病原种类。

Colletotrichum kahawae 在过去很长一段时间被当做C. gloeosporioides。

但是，Waller and Bridge重新对咖啡果刺盘孢的形态特征、培养特征和生化特征进行描述并建立一个新种C. kahawae。

最近，应用多基因分子系统学也进一步确认了C. kahawae的分类地位。

近些年来，通过多基因分子系统学结合表型特征的研究，C. gloeosporioides复合种的许多隐含种 （cryptic species）被发现和描述。

目前， C. gloeosporioides复合种（species complex）包括C. asianum、C. fructicola、C. horii、C. jasmini-sambac、C. kahawae、C. gloeosporioides 和 C. siamense 等这些曾经作为隐含种的种类, 以及与C. kahawae 亲缘关系很近的刺盘孢属真菌，如C. cordylinicola、C. ignotum、C. musae 和 C. tropicale。

C. gloeosporioides复合种下的种类间的形态学特征常常相互重叠并难以区分 (Cai et al., 2009; Hyde et al., 2009), 因此区分和鉴定这些种类对分类学家仍然是一个很大的挑战。

到目前为止，还没有一个特异的、灵敏快速的分子检测方法用于重要的病原刺盘孢属真菌的检测和鉴定，如 C. kahawae。

尽管过去有许多分子方法用于病原刺盘孢属真菌的检测，但这些方法不能特异性检测C. gloeosporioides复合种下的种类。

尽管ITS序列已经被选择做为真菌界的通用条形码，但它在解决Colletotrichum gloeosporioides复合种的分类和鉴定问题的结果并不令人满意。

尽管多基因分子系统学在解决刺盘孢属复合种非常有效，但是，通过多基因分子系统学分析需要专业人员和较长时间。

因此，建立刺盘孢属重要病原菌快速和有效的分子检测方法在实践和应用研究都是十分必要的。

Real-time PCR是一种迄今应用很广泛的分子检测方法，通过设计特异性的引物和探针对被检测的目标微生物进行特异地鉴定和探测。

该技术已成功用于多种植物病原真菌及其它微生物的定性及定量检测。

本标准根据咖啡浆果炭疽病菌的分子生物学特征及实时荧光PCR原理和环介导恒温扩增 (Loop-mediated isothermal amplification，LAMP) 技术原理，应用所涉及引物或探针对咖啡浆果炭疽病菌进行检测鉴定。

目前，我国已将咖啡浆果炭疽病菌列为进境植物检疫性有害生物，国内至今也未见有该病害的报道。

我国每年需要从国外进口大量的咖啡生豆，因此，必须高度警惕，加强检疫工作，把好无病种子关，杜绝咖啡浆果炭疽病传播蔓延。

在出入境植物检验检疫时，需快速准确地对该病菌进行鉴定。

因此，制定咖啡浆果炭疽病菌检测鉴定方法，对防止咖啡浆果炭疽病菌随种子及其它繁殖材料进出口、调运而传播蔓延，以保护我国农业生产的健康发展，具有重要的意义。

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本标准规定了咖啡浆果炭疽病菌的检疫鉴定方法。 本标准适用于植物及其他相关植物产品中咖啡浆果炭疽病菌的检测。应用于进出口植物及其相关产品、国内有害生物监测等植物检疫工作中发现的疑似该病菌的鉴定。 本标准的主要技术内容是根据咖啡浆果炭疽病菌在寄主上的症状特点、寄主范围、培养及形态特性、荧光PCR特异性扩增、LAMP扩增检测结果等为鉴定依据，对咖啡浆果炭疽病菌病菌及其近似种进行识别和鉴定。

2016年国家重点研发计划专项“国家质量基础的共性技术研究与应用（NQI）”中《高频跨境生物多目标高精准检测技术研究》项目（编号：2016YFF0203200）。

一种咖啡浆果炭疽病菌快速分子检测试剂盒及其应用. 专利申请号：201210044952.4